注：根据《国家税务总局关于公布全文失效废止、部分条款失效废止的税收规范性文件目录的公告》（国家税务总局公告2011年第2号2011-01-04）规定，全文失效。

各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局：
        近接中国科学院《关于我院所属科学事业单位缴纳企业所得税有关问题的请示》（科发计字[1999]0446号）。根据《国家税务总局印发〈事业单位、社会团体、民办非企业单位企业所得税征收管理办法〉的通知》（国税发[1999]65号）的有关规定，考虑到中国科学院及其所属科学事业单位的特殊情况，现对中国科学院及其所属科学事业单位在1999年缴纳企业所得税时，有关“财政拨款”的确认、固定资产折旧的税务处理问题规定如下：
        一、关于“财政拨款”的确认
        （一）对中国科学院及其所属科学事业单位取得财政部门直接拨付的经费，以财政部门和主管部门拨款单为财政拨款的确认证明；中国科学院及其所属科学事业单位之间转拨的财政经费，以取得的转拨单和汇款单为财政拨款的确认证明。转拨单必须经中国科学院财务主管部门审核签章后，再由所属科学事业单位转交其所在地主管税务机关。
        二、对中国科学院及其所属科学事业单位取得不是由财政部门直接拨付，而从其他部门取得的由财政资金设立的科技项目（课题）经费，以中国科学院及其所属科学事业单位与有关部门签订承担该项目（课题）的合同、协议、计划任务书，作为财政拨款的确认证明。这些项目（课题）包括：
        1、国家自然科学基金（由国家自然科学基金委员会管理）；
        2、国家高技术研究发展计划（又称863计划）（由国家科技部管理）；
        3、攀登计划以及攀登计划预选项目（由国家科技部管理）；
        4、国家重点基础研究项目（又称973项目）（由国家科技部管理）；
        5、国防军工项目以及军品配套研制项目（由军委各总部、军兵种、国防科工委以及军队各基地和部队管理）；
        6、国家科技三项费项目（包括技术创新项目、引进技术消化吸收项目、中小企业创新支撑体系建设项目、产学研联合开发工程示范项目等）（由国家计委管理）；
        7、国家一次性科学事业费专项经费（由国家科技部管理）；
        8、国家科学事业费政策性调节费（由国家科技部管理）；
        9、国家基础研究特别支持费（国家科技部管理）；
        10、国家科技攻关项目（由国家计委、科技部管理）；
        11、国家产业化示范工程项目（由国家计委管理）；
        12、国家工程研究中心项目（由国家计委管理）；
        13、国家技术工程研究中心项目（由国家科技部管理）；
        14、国家载人航天工程项目（又称921项目）（由国防科工委、解放军总装备部管理）；
        15、地方政府财政资金设立的项目
        二、关于固定资产折旧的税务处理问题
        中国科学院及其所属科学事业单位在计算缴纳1999年度企业所得税时，允许在所得税前扣除的折旧额按下列方法计算：
        第一步：先计算单位全部固定资产折旧额，公式为：
        E单位固定资产折旧额（直线法）=
        （单位各类固定资产原值―预计残值）÷折旧年限
        第二步：计算在税前扣除的固定资产折旧额，公式为：
        实际计入税前成本费用的折旧额=单位全部固定资产折旧额×（应税收入÷全部收入）―当年提取并列入经营成本费用的修购基金